“时疫”又称之为“时病瘟疫”，或日“时疫温病”，类似急性传染病。在中医针灸文献中，关于防治“时疫”的记载十分丰富，其中以刺血与艾灸疗法为多。
早在清代《针灸逢源》中即记载：“瘟疫六七日不解，以致热入血室，发黄，身如烟熏，目如金色，口燥而热结，砭刺曲池出恶血，或用锋针刺肘中曲泽之大络，使邪毒随恶血而出，极效。”中医认为，疫疠之邪侵入人体，而邪气受体内正气的排斥，往往会驱邪于肢体末端部位，或滞留在关节曲折之处，以及末梢部与大关节部是邪气集聚之处，取上述所处之穴位，采用刺血疗法，就可以达到驱邪外出之目的。在刺血疗法的操作中，古人也有经验之谈，如用绳带将肢体扎紧，使局部血管内压力增高，血管暴露，再予针刺，以增大出血量等。如清代的《针灸大成》就说：“虾蟆瘟，瘟热大炽，咽肿闭塞，口噤不语，不食，颌下亦肿……急以三棱针，刺头额少阳血络及太阳血络，多出恶血，继以绸系其肩下臑上，即针刺左右尺泽大小血络及委中血络，并弃血如粪，则不日而饮水，神效。”
艾叶用于防治疾病已有2 000多年的历史。艾叶性温，燃之则有温补阳气、扶正祛邪之作用。至今，在湖北蕲春等地，还流传着“家有三年艾，郎中不用来”的谚语；更有不少地方户户种植，家家收藏艾叶。是故孟子云：“七年之病，求三年之艾。”可见艾灸在防治疾病方面确有殊功。
灸法有预防瘟疫感染的作用。如唐代《千金要方》载述：“凡人吴蜀地宦游，体上常须带两三处灸疮，勿令疮暂差，则瘴疠温疟毒气不能著人也，故吴蜀多行灸法。”清代《太乙离火感应神针》还有灸气海穴以治疗“凝滞若痞，山岚瘴疠”的记载。研究证明，艾灸可改善机体免疫功能，从而抵抗细菌、病毒的侵犯，所以用灸法防治“时疫”是有科学根据的。
常用灸法如：采用艾条(以无烟为好)，或者一些能起到类似作用的电子灸疗仪，取足三里、内关，儿童可加身柱，老年人可加筋缩、脾俞、胃俞、肾俞等，每天灸15～30分钟，连续5天，休息2天后再灸。此法可提高健康人机体免疫功能。