阴茎疼痛往往是某些疾病、外伤的突出表现。机体出现问题或受到伤害时，常用疼痛来引起你的注意或向你提出警告，阴茎疼痛也是如此。不管是阴茎表面的疼痛还是内部的疼痛都应引起重视。
(1)外伤
虽然阴茎地处隐蔽，而且平时体积也比较小，但仍有可能出现外伤。最常见的是骑跨在硬物上，将阴茎撞伤。阴茎表皮的损伤主要是被虫咬伤。极少数的男士因为性生活中动作过于猛烈或突然改变方向，使得阴茎折断。
(2)疱疹病毒感染
一些病毒侵犯阴茎后，常会引起疼痛，常见的有生殖器疱疹。感染后，阴茎会有灼烧、发痒、疼痛的现象。
(3)前列腺炎
前列腺发炎常常会引起阴茎的疼痛。
(4)非淋病性尿道炎
这是一种尿道感染，主要通过性行为进行传播。患者除了发现尿道有脓性分泌物外，还有小便时疼痛，阴茎周围灼热、疼痛、发痒等。
（5)阴茎癌
要辨认阴茎癌并不困难，．从器官的表面就能看到病变的组织。除非是受到感染，否则阴茎癌通常都不会引起疼痛。
(6)异常勃起
有时勃起竟会引起阴茎疼痛。勃起阴茎的动脉里形成血凝块时，就会阻止血液从阴茎流出，使得阴茎勃起的时间远远超过正常时间，形成剧烈的疼痛。
（7)佩罗尼病
又叫阴茎弯曲，是由于阴茎里形成疤痕组织而引起的一种渐进性疾病。有病的组织在阴茎上形成斑块。当阴茎勃起时，斑块使得阴茎弯曲并疼痛。有时斑块会自行消失，有时必须通过手术进行矫正。
体检指南
阴茎疼痛的严重程度与病情轻重并没有对应关系，所以疼痛不论轻重都应引起足够重视。有些男性仅仅因为害羞，不到痛得难以忍受不会上医院，结果使病情延误。