1.抗脉络膜抗体 
【正常值】血凝法:为阴性。
【临床意义】 阳性，主要见于交感性眼炎、脉络膜炎。
2.抗脑组织抗体
【正常值】血凝法和补体结合法:均为阴性。
【临床意义】阳性，见于多发性硬化病、多发性神经炎、接种后及感染后脑炎。
3.抗甲状腺球蛋白抗体(ATGA)
【正常值】间接免疫荧光法:小于1:10为阴性；滴金法:为阴性；酶联免疫吸附试验:为阴性。
【临床意义】血清ATGA是诊断甲状腺自身免疫性疾病的一个特异性指标，80%～90%的慢性甲状腺炎病人及60%的甲状腺功能亢进病人此值可呈强阳性。甲状腺功能亢进病人在治疗过程中，会发生一过性的甲状腺功能低下，此情况的发生，与ATGA密切相关。ATGA可作为甲状腺肿块鉴别诊断的指标，其阳性一般考虑为慢性淋巴细胞性甲状腺炎，而非甲状腺肿块。正常妇女，随着年龄的增长，ATGA阳性检出率增加，40岁以上可达18%，这可能是自身免疫性甲状腺疾病的早期反应。ATGA阳性，还见于原发性甲状腺功能减退、某些肝脏病、各种胶原性疾病、重症肌无力等。
4.抗甲状腺微粒抗体(ATM)
【正常值】阴性(<15%)。
【临床意义】ATM阳性，主要见于慢性淋巴细胞性甲状腺炎与甲状腺功能亢进，其阳性率可达60%～90%；还有甲状腺肿瘤、亚急性甲状腺炎、系统性红斑狼疮等也呈阳性。
5.抗甲状腺过氧化物酶抗体(ATPO)
【正常值】间接免疫荧光法:<1:10为阴性；滴金法:为阴性；酶联免疫吸附试验:为阴性。
【临床意义】阳性，主要见于慢性淋巴细胞性甲状腺炎、甲状腺功能亢进、原发性甲状腺功能减低。某些病人抗甲状腺球蛋白抗体(ATG)阴性，但ATPO阳性，因而两种抗体同时检测，可提高抗甲状腺自身抗体阳性的检出率，并可作为临床诊断和鉴别诊断自身免疫性甲状腺炎的重要依据。
6.抗肾上腺抗体
【正常值】荧光抗体法:为阴性。
【临床意义】 阳性，主要见于艾迪生病。
7.抗肾上腺皮质抗体
【正常值】免疫荧光法:为阴性。
【临床意义】 阳性，常见于慢性肾上腺皮质功能减退，阳性率为50%左右，滴度为1:64。
8.抗肾小球基底膜抗体(AGBMA)
【正常值】阴性。
【临床意义】阳性，主要用于肾小球肾炎的分型诊断与鉴别诊断，约5%的肾小球肾炎由AGBMA引发，为自身免疫性疾病。
9.胰岛细胞抗体(ICA)
【正常值】免疫荧光法:为阴性。
【临床意义】 新诊断的胰岛素依赖型糖尿病病人，60%～70%的血清中胰岛细胞抗体(ICA)为阳性。胰岛细胞抗体出现在糖尿病发病之前，故检测胰岛细胞抗体对糖尿病及胰岛素依赖型糖尿病的早期发现及治疗有重要意义。
10.抗胰岛素抗体（IAB)
【正常值】阴性。
【临床意义】 检测IAB，可用于监测患者的胰岛素耐量。IAB在体内与胰岛素结合，形成抗原抗体复合物，使胰岛素的活性明显降低甚至无效，从而导致胰岛素依赖性糖尿病必须注入大量胰岛素才能有效。
11.抗心肌抗体(AMA)
【正常值】阴性。
【临床意义】阳性，见于心脏术后综合征、心肌梗死后综合征和风湿性心脏病等。
12.抗心磷脂抗体(ACA)
【正常值】阴性。
【临床意义】阳性，见于抗心磷脂抗体综合征、心肌梗死、卒中(或中风)、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、硬皮病、干燥综合征、肿瘤、疟疾等。
13.抗平滑肌抗体(ASMA)
【正常值】间接免疫荧光法:<1:10为阴性。
【临床意义】阳性，见于狼疮性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、慢性活动性肝炎等。
14.抗骨骼肌抗体
【正常值】免疫荧光法:为阴性。
【临床意义】 阳性，见于重症肌无力、胸腺瘤等，其阳性率为30%～50%。
15.抗胃壁细胞抗体（APCA)
【正常值】免疫荧光法:≤1:10为阴性。
【临床意义】阳性，常见于恶性贫血、慢性低色素性贫血、单纯萎缩性胃炎、胃癌等。
16.抗结肠抗体
【正常值】血凝法:为阴性。
【临床意义】 阳性，主要见于溃疡